5.3 BioLine 宿主侧脚本

宿主侧脚本按当前执行车道协调 BioLine 与本地隔离任务，不选择静态 pipeline 或 Skill 子集。

• gateway.sh 接收目标和输入，调用规划流程并展示待确认的 Flow、输入绑定与下游目标。
• orchestrator.sh 记录 Flow/Job 生命周期；先动态发现并检查 Flow，再经用户确认提交 Job，成功后下载结果并 finalize 到 stage。
• prepare_downstream.sh 解析精确的 BioLine Tool NAME:VERSION，导出对应 summary/config，检查下游标记和空固定命令字段，再按需拉取版本。
• run_downstream.sh 使用当前任务生成并保存的脚本执行分析；stage 与任务复现材料只读挂载，network none，分析输出目录可写。
• attach.sh 不用于向正在运行的容器追加分析能力或修改已生成的 Tool。新的分析请求应重新检查现有 Tool 和输入，再形成单独的任务脚本。
• stop_downstream.sh 按任务拉取记录执行受限清理：仅当镜像由当前任务拉取、拉取前不存在、身份未改变且没有被共享或使用时，才尝试非强制删除；不会清理预存镜像或执行 prune。

每项分析能力都是 BioLine Tool。五个历史镜像只作迁移盘点；没有合适的现有 Tool/Flow 时，应进入独立的创作和确认流程。