5.5 批量任务（per-sample batch）

BioLine对批量样本的处理模式为以下过程：

• 系统会先扫描用户的 BioLine 目录，尝试按子目录、成对命名或单文件方式识别样本。
• 共享文件，例如宿主参考基因组或 metadata，会被单独识别出来，而不是在每个样本里重复上传。
• 每个样本会拥有自己的 BioLine pipelineId 和状态。
• 云端输出的命名会带上 Job 与样本编号，例如 open-<job-id>-<sample-id> 这类形式。
• 下载到本地之后，每个样本的产物会进入 stage/<category>/<sample-id>/，避免同名覆盖。
• 这批样本的整体状态会写在 .batch_state.json 中。