3.3 第一次使用前需要准备什么
首次使用前,准备好 BioLine 访问权限、fkit、输入数据和满足所选 Tool 资源要求的宿主环境。
- 上游 Flow 需要有效的 BioLine 账号及可读的数据路径;凭据由 fkit 管理,不写入任务目录。
- 下游任务需要兼容的本地容器运行环境,以支持断网执行、stage 只读挂载和任务输出写入。
- 本地磁盘空间用于按需拉取的具体 Tool 版本、输入暂存和结果。无需预先下载整套历史镜像。
- CPU、内存、磁盘和 GPU 要求以选定 Tool 的 config/summary 与宿主运行环境为准;仅在该 Tool 明确支持且宿主兼容时使用 GPU。
- 输入格式取决于分析目标和所发现 Tool/Flow 的接口。常见输入包括双端 FASTQ、丰度或通路表、ASV 表及 metadata.tsv。
| 项目 | 用途 |
|---|---|
| fkit 与 BioLine 账号 | 发现、检查和运行平台上的 Flow、Job 与 Tool。 |
| 容器运行环境 | 在受限本地边界中运行下游任务脚本。 |
| 可用磁盘和计算资源 | 容纳本次精确 Tool 版本及输入和输出。 |
不需要为某个固定的历史镜像集合准备本地存储。开始分析前先发现现有 BioLine Tool/Flow,并检查其精确版本、文档和资源配置;没有合适能力时,再按需创建。
