6.3 如何解读结果

面对一份微生物组或丰度表结果时，至少可以获得以下几点信息。

• 样本量是否足够支撑组间比较。
• 是否存在明确而可靠的分组信息。
• 未分类比例是否过高。
• 物种数与多样性范围是否合理。
• 群落特征是否与样本来源相符，例如口腔样本、肠道样本是否呈现出合理的主要菌群特征。

一些示例解读如下：

• 在口腔微生物组示例中，Prevotella、Veillonella、Neisseria、Streptococcus 可能占主导。
• 如果未分类比例达到约 45%，在复杂群落中并不一定异常。
• Alpha 多样性在示例中可能没有显著差异。
• Beta 多样性也可能没有显著分离。
• 差异物种在做 FDR 校正后，可能并不会出现显著结果，特别是在模拟 metadata 或样本量不足时，这种现象是合理的。